很久很久以前，在那个战火纷飞的年代，每个国家都在为本国的领土扩张而不停地发动战争。而在那个时代，战争的主力——忍者们还没有形成忍者村这样的军事集团。而是以家族为基本单位，自相残杀着。而在这众多的忍着族群中，有两个令人畏惧的最强族群：在拥有万花筒写轮眼的宇智波斑的领导下，号称拥有洞察一切查克拉的写轮眼的宇智波一族;以及在拥有秘传木遁术的千手柱间的领导下，号称忍术最强的森之千手一族。

　　世上不可能有两个最强，于是宿命般地，森之千手一族与宇智波一族遭遇了。

　　然后，战争开始了。

　　因为同样在乱世中生存下来的家族，他们拥有同样的小心与谨慎。战争并没有在一开始就全面爆发，而是以互相的试探以及小规模的战斗为形式而逐渐展开。

　　于是渐渐地，千手柱间和宇智波斑互相对对方产生了浓厚的兴趣。“如果他能加入我们，吾之一族将天下无敌。”差不多是在同一个时候，双方都在脑海里产生了这样的念头。

　　然后在接下来的战斗中，千手柱间和宇智波斑遭遇了。

　　没有客套的寒暄，双方一开始就用上了全力，因为双方都清楚，留手等于送死。

　　就在双方激烈战斗，各自准备使出必杀手段的时候，无数的手里剑向两人袭来。

　　原来，实力稍逊森之千手一族与宇智波一族一筹的无名龙套一族看准了两族交战的时机，想趁机将两族一网打尽，从而成为忍界最强的家族。很显然，如果这两族的首领同时暴毙，对无名龙套一族有百利而无一害。

　　在这千钧一发之际，千手柱间和宇智波斑同时明白了无名龙套一族的整个计划。“暂时联手?”“同意。”寥寥数语加上一瞬间的眼神交会，最强的两人成为了最强的临时组合。

　　但是无名龙套一族也并非泛泛之辈，被占尽天时地利人和之后，即使强如这两人，也只能拼尽全力逃走而无反击之力。更何况，已经没时间了。

　　一天之后，森之千手一族与宇智波一族就将在终结之谷展开一场死斗，千手柱间和宇智波斑在下令之时，都认为这是消灭对方的最好时机。但是现在，两个人都很明白，双方都会被无名龙套一族消灭。

　　在躲避追杀的过程中，千手柱间和宇智波斑开始对对方有了更深的了解。而宇智波斑更是折服与千手柱间描述的理想中的木叶村的愿景。

　　“和我一起建立木叶吧。”听到千手柱间的话，一生以来的第一次，宇智波斑有了臣服于某个人的念头。

　　就在森之千手一族与宇智波一族展开决战前的一瞬间，千手柱间和宇智波斑一起出现，各自告知了自己的族人无名龙套一族的阴谋，并联手粉碎了这个阴谋。

　　然后，以此为契机，最强的两个家族成为了同盟。并在终结之谷建造了两尊雕像纪念这两个人。

　　在吸引了日向一族，油女一族，奈良一族等诸多忍者家族的加入之后。木叶村成立了。千手柱间成为了村长，而宇智波斑成为了他的助手。

　　但是事情还没有结束，

　　宇智波一族对于自己在木叶村中的地位感到不满，利用自己承担木叶警卫的优势，一直在密谋夺取木叶村的主导权。仅仅是因为对宇智波斑的畏惧，才没有付诸行动。

　　宇智波斑也有个大问题。

　　在夺取了弟弟的眼睛之后，他获得了永恒的万花筒写轮眼。但是在获得最强瞳力的同时，他弟弟的意识也深植于他的脑海。被最亲的哥哥背叛让斑的弟弟成为了想要夺取哥哥的身体，然后毁灭一切的恶鬼。

　　终于，某一天，弟弟成功了。

　　闻讯赶来的千手柱间试图阻止自己最值得信赖的助手。两个人重新开始了多年以前草草结束的那场宿命之战。在终结之谷，千手柱间拼尽全力终于阻止了斑的弟弟暴走，而重新获得身体主导权的斑出于愧疚，也出于阻止弟弟的目的，要求千手柱间杀了自己。

　　“想死就自己动手”千手柱间留下了这么一句话之后转身离去。留下斑独自淋了一晚上雨。

　　第二天，斑改名换姓回到了木叶，开始着手建立“根”组织，在背后默默地守护木叶。

　　初代死后，斑开始通过“根”争夺火影之位。因为，值得自己效忠的人，这世界只有一个。但是，斑更不想将初代火影的心血毁于一旦。因此，斑将自己的行动控制在了不危害木叶利益的范围内。

　　许多年以后，斑的弟弟再次找到机会控制了斑的身体召唤来九尾，并煽动宇智波一族叛乱。这次，是四代火影以生命为代价，将九尾封印。

　　但是这次事件让各大忍村开始竞相制造人柱力。为了保护木叶，斑成立了“晓”。通过各种手段收集尾兽，避免它们成为木叶的威胁。

　　几年以后，知道宇智波一族即将叛乱的斑通过“根”下令，将宇智波一族灭门。

　　再过了若干年，火影的第一部开始。